支原体肺炎的治疗主要依赖于抗生素的选择和使用。首选的抗生素是大环内酯类的药物，如阿奇霉素、红霉素、罗红霉素、克拉霉素等。这些药物对于支原体肺炎的治疗效果较好。
阿奇霉素治疗支原体肺炎的原理主要是通过抑制细菌转肽过程，从而抑制细菌蛋白质的合成，达到抗菌效果。同时，阿奇霉素对其它微生物也有抑制作用。
支原体肺炎是由支原体感染引起的疾病，阿奇霉素可以有效地抑制支原体蛋白质的合成，从而杀灭支原体，达到治疗支原体肺炎的效果。
另外，阿奇霉素的用药方法也比较方便，成人用量一般为每次0.5g，每天1次，至少连续静滴2天，继之换用口服阿奇霉素口服0.5g/天，治疗7～10天为一个疗程，治疗时间调整应由医生根据临床反应确定。
如果症状严重或出现其他细菌或病毒感染的混合感染，也可选择喹诺酮类的三代、四代药物进行治疗，如左氧氟沙星和莫西沙星等。对于社区获得性肺炎比较严重的患者，尤其是高度怀疑有肺炎支原体导致的肺炎时，这些喹诺酮类药物可能是更好的选择。
糖皮质激素在治疗普通支原体肺炎中并不常规使用，但对于起病迅速的患者或难治性支原体肺炎的患者，可以考虑使用糖皮质激素治疗，如甲泼尼龙等。
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